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Université Montpellier Sup Agro (2021)

Génomique de l’adaptation de l’olivier au changement climatique : identification des marqueurs associés à la sécheresse et aux besoins en froid pour sélectionner les génotypes les mieux adaptés

Aqbouch Laila

Titre : Génomique de l’adaptation de l’olivier au changement climatique : identification des marqueurs associés à la sécheresse et aux besoins en froid pour sélectionner les génotypes les mieux adaptés

Auteur : Aqbouch Laila

Université : Université Montpellier Sup Agro

Discipline : Génétique et amélioration des plantes

Sous la direction de : Stéphanie Sidibe-Bocs.

Résumé
Cette thèse a pour objectifs : i) de reconstruire les deux haplotypes d’un génome complet diploïde hétérozygote de référence pour la variété "Picholine marocaine" et annoter les gènes connus, ii) d’identifier les variants alléliques phasés en s’appuyant sur le mapping des données de reséquençage du génome complet de 200 variétés de la collection mondiale de Marrakech sur le génome de référence (i), iii) de détecter les régions génomiques sous sélection positive à partir des variants alléliques, iv) d’identifier les régions génomiques associées aux traits phénotypiques liés aux besoins en froid pour la floraison et à la résistance à la sécheresse à partir des variants alléliques (ii) et d’une matrice multi-traits fournie par le projet ClimOliveMed, v) de définir une combinaison pertinente de marqueurs issus des régions génomiques détectées (iii et iv) pour la caractérisation des ressources génétiques locales et la sélection des génotypes adaptés au changement climatique.

En préparation depuis le : 12-04-2021 .

Source : Theses.fr

Page publiée le 26 octobre 2021