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Université Mustapha Stambouli de Mascara (2021)

Activité antifongique de quelques champignons isolés de la grande sebkha d’Oran sur certaines maladies cryptogamiques des plantes

Chamekh, Rajaa

Titre : Activité antifongique de quelques champignons isolés de la grande sebkha d’Oran sur certaines maladies cryptogamiques des plantes

Auteur : Chamekh, Rajaa

Université de soutenance : Université Mustapha Stambouli de Mascara

Grade : Doctorat Microbiologie Appliquée 2021

Résumé
La grande sebkha d’Oran est une dépression fermée d’une superficie de 1890 Km2située au nord-ouest de l’Algérieà 12 km de la Mer Méditerrané. Malgré le classement de cette sebkha parmi les zones humides d’importance mondiale par la convention de Ramsar en 2002, aucune étude sur la communauté fongique de cette zone n’a été réalisée. Dans notre étude, les échantillons ont été prélevés dans deux régions différentes sur une superficie de 5 km2. La première région est caractérisée par une végétation halophile et des cultures céréalières et la seconde par une absence totale de végétation. Les résultats ont montré que le sol de la sebkha est alcalin, à l’exception du sol des cultures céréalières qui est neutre, et extrêmement salin. Un total de 136 isolats de 24 genres et 43 espèces dont 13espèces non identifiées ont été isolés dans les deux régions. En général, les champignons isolés sont similaires à la mycoflore des écosystèmes hypersalins. La première région a été plus diversifiée en isolant 32espèces de 17 genres. Les genres prédominants étaient Fusarium, Aspergillus, Penicilliumet leurs formes téléomorphes Aspergillusamstelodamiet Penicilliumegyptiacum. Dans la deuxième région, 21espèces de 14 genres ont été isolées avec une prédominance des espèces Aspergillusamstelodami, Penicilliumegyptiacum, Alternaria sp.et Gymnoascusdenkaliensis. Parmi cette mycoflore isolée, les espèces Gymnoascus halophilus, Trichoderma gamsii, Fusariumbrachygibbosumet Penicilliumalliiont été isolées pour la première fois en Algérie. Les résultats ont également montré que Gymnoascus halophiluset Wallemia sp.sontles seules espèces halophiles obligatoires, les autres souches sont halotolérantes. Toutes les souches sont capables de sécréter au moins une des quatre enzymes testées (amylase, lipase, protéase, cellulase). La meilleure activité enzymatique a été observée chez les espèces Aspergillus sp. souche A4, Chaetomium sp.souche H1, Penicillium vinaceum, Gymnoascushalophiluset les deux basidiomycètes Wallemia sp.et Ustilago cynodontis. La plupart des souches ont inhibé in vitrola croissance de Fusariumoxysporumpar confrontation directe sur milieu sans NaCl ; en présence de 2% NaCl, la moyenne du taux d’inhibition de l’ensemble des souches a significativement augmenté. La meilleure activité antifongique en présence et en absence du NaCl a été observée chez les deux souches Trichoderma sp.et T. gamsii. Ces deux souches ont montré aussi un pouvoir antagonistein vitroimportant contre quatre champignons phytopathogènes Fusarium oxysporum f. sp. Lycopersici, Sclerotinia sclerotiorum,Rhizoctonia solanietAlternaria alternataen secrétant des substances antifongiques volatiles. In vivo, les deux souches avaient un effet préventif et curatif significatif contre l’alternariose de la tomate causée par Alternaria alternataen réduisant le diamètre des lésions.Malgréla petite superficie de notre zone d’étude, ce travail est le premier rapport sur la biodiversité fongique de la grande sebkha d’Oran et qui montre que ce sol hypersalin abrite une remarquable diversité fongique et qui peut être une source importante de souches d’intérêt biotechnologique.

Mots Clés  : sebkha diversité fongique halotolérance enzymes hydrolytiques activité antifongique contrôle biologique

Présentation

Version intégrale (15,2 Mb)

Page publiée le 24 décembre 2021