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sur le développement des zones arides et semi-arides

Titre : Épidémiologie et résistance au Pyrenophora Tritici Repentis la tâche bronzée / Tan spot en Tunisie

Auteur : LARIBI Marwa

Etablissement de soutenance : Institut National Agronomique de Tunis (INAT) – Université de Carthage

Grade : Doctorat en Sciences Agronomiques Specialty Plant Production Sciences 2022

Résumé partiel
La tache bronzée, causée par Pyrenophora tritici-repentis (Ptr), est une maladie foliaire du blé dans le monde entier. Cette maladie est devenue plus répandue en Afrique du Nord et en particulier en Tunisie. Actuellement, huit races (1-8) ont été identifiées en fonction de leur capacité de provoquer des symptômes de nécrose ou de chlorose sur une gamme d’hôtes différentielle associés à la production de trois effecteurs nécrotrophes (ENs) spécifiques à l’hôte, Ptr ToxA, Ptr ToxB et Ptr ToxC , produits séparément ou en combinaison, sur une série différentielle composée de quatre hexaploïdes (‘Glenlea’, 6B662, 6B365, ‘Salamouni’) et de deux tétraploïdes (‘Coulter’ et 4B-160).

Pour évaluer la variation physiologique de Ptr en Tunisie, 84 isolats monosporales, ont été caractérisés. L’évaluation de la virulence des isolats a été effectuée dans des conditions contrôlées sur la série différentielle et a permis l’identification des races 2, 4, 5, 6, 7 et 8. La race 2 a été identifiée pour la première fois en Afrique du Nord, à une fréquence basse de 5%. Les races 5 et 7 étaient les plus fréquentes représentant, respectivement, 39 % et 43 % des isolats testés. Les races 6 et 8 ont été trouvées à basse fréquence, 8% et 4%, respectivement. Enfin, un seul isolat de Ptr était non-pathogénique et désigné comme race 4.

Afin de mieux comprendre la structure raciale des isolats de Ptr, une collection d’isolats de Ptr a été testée pour la présence des gènes ENs ToxA, ToxB et toxb par analyse PCR. Alors que les races 2, 4, 5, 6, 7 et 8 ont été identifiées en fonction de leurs phénotypes de virulence, les tests PCR ont indiqué la présence d’isolats « atypiques » qui ont induit une nécrose sur le différentiel de blé ‘Glenlea’, mais qui manquaient le gène ToxA attendu, suggérant l’implication d’autres ENs dans l’interaction Ptr / blé. Par ailleurs, la diversité génétique et la structure de la population de Ptr ont été explorées, en examinant 59 isolats tunisiens et 35 isolats d’Algérie, d’Azerbaïdjan, du Canada, d’Iran et de la Syrie à l’aide de 24 marqueurs de séquences répétées en tandem. La diversité génétique moyenne, le flux génétique global et le pourcentage de loci polymorphes ont été estimés à 0,58, 2,09 et 87 %, respectivement. L’analyse de la variance moléculaire a montré que 81% de la variance génétique se produisait au sein des populations et 19% entre les populations. Le dendrogramme UPGMA a indiqué que les isolats de ToxBétaient groupés et éloignés des isolats de ToxB+ . Sur la base de l’analyse de Nei, la collection mondiale s’est regroupée en deux groupes distincts en fonction de leur région d’origine. Les résultats suggèrent que l’origine géographique et la spécificité de l’hôte imposée par différents NE peuvent générer une différenciation entre les populations Ptr.

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