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sur le développement des zones arides et semi-arides

Titre : Exopolymère de Ramlibacter tataouinensis : optimisation de sa production , caractérisation biochimique et génétique

Exopolymer of Ramlibacter tataouinensis : optimization of its production, biochemical and genetic characterization

Auteur : Jivkova, Desislava

Université de soutenance : Aix-Marseille Université

Grade : Doctorat : Microbiologie : Aix-Marseille : 2018

Résumé
Les exopolysaccharides (EPS) bactériens peuvent avoir une haute valeur ajoutée comme agents de rétention d’eau en cosmétologie. Cette étude s’est intéressée à l’EPS de Ramlibacter tataouinensis TTB310 (Rta). Cette bactérie, isolée d’un sol semi-aride, possède un cycle cellulaire particulier avec des bâtonnets mobiles sensibles à la dessiccation et des kystes non-mobiles produisant un EPS lui permettant de tolérer la dessiccation prolongée. La production d’EPS et la croissance ont été optimisées par le choix de lactate comme source de C et d’énergie, le maintien du pH pendant la croissance avec de l’acide lactique, l’augmentation des concentrations des autres substrats et l’ajout des micro- et macro éléments. Ainsi des quantités suffisantes d’EPS ont été obtenues. Une extraction de l’EPS fermement attachée à la surface des bactéries en utilisant de l’acide trichloroacétique a été élaborée et optimisée. La caractérisation biochimique de l’EPS a été réalisée en combinant différentes techniques : CPG, FTICR-MS, RMN et FTIR. L’unité répétée de l’EPS de Rta est un décasaccharide constitué de ribose, glucose, galactose, mannose, rhamnose, acide glucuronique, désoxyhexose et avec des substituants tels que acétyle, succinyle et méthyle. Enfin, grâce à la disponibilité du génome entièrement séquencé de Rta, le cluster de gènes impliqué dans la production d’EPS a été identifié à l’aide des approches de biologie moléculaire et d’imagerie. La connaissance de la structure de l’EPS de Rta permettra de mettre au point les modifications physico-chimiques nécessaires à sa solubilisation pour en étudier les propriétés rhéologiques.

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