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sur le développement des zones arides et semi-arides

Titre : Caractérisation biologique, pathologique et moléculaire de l’alternariose des agrumes causée par Alternaria alternata et approche de lutte biologique par des huiles essentielles

Auteur : GRATI AFFES Taycir

Etablissement de soutenance : Institut National Agronomique de Tunis (INAT) – Université de Carthage

Grade : Doctorat en Sciences Agronomiques 2022

Résumé
Nos travaux de caractérisations macroscopiques, microscopiques et moléculaires des différents isolats collectés ont bien confirmé que l’agent causal de l’alternariose des agrumes dans la région du Cap-Bon s’agit bien de Alternaria alternata. Afin de proposer une méthode de lutte biologique, nous avons criblé plusieurs espèces végétales pour en extraire les huiles essentielles et tester leurs propriétés antifongiques. Les huiles essentielles d’écorces d’agrumes ont montré qu’elles étaient caractérisées par la prédominance du limonène (62,70- 92,80%). Le 1,8-cinéole est le composé majeur des huiles essentielles des feuilles de melaleuque (57,55%), romarin (49,48%) et thym (49%). Les huiles essentielles de myrte étaient riches en α-pinène (49,13%) et riche en 1,8-cinéole (31,08%), tandis que celles de la menthe poivrée sont plutôt riches en menthol (55,51%) et menthone (23,01%). L’huile essentielle de thym était riche en carvacrol (78,54%) tandis que celle de cyprès contenait principalement du germacrene-D (34,26%) et de l’α-pinène (22,71%). Les huiles essentielles du laurier, du myrte et de la menthe poivrée ont montré une richesse en composants bioactifs ayant une activité antimicrobienne à large spectre (CIM = 1500, 2000 and 3000 µg/mL, respectivement). Toutes les huiles essentielles d’agrumes avaient une faible activité antifongique contre A. alternata (CIM = 8000-12000 µg/mL). Les huiles essentielles de feuilles de romarin et de melaleuque avaient une activité antifongique plus élevées (CIM = 5000 µg/mL) que les huiles essentielles des huiles essentielles de thym et de cyprès (CIM = 6000 µg/mL). Le mélange de tween 20, de caséine et de maltodextrine était l’émulsion la plus stable et ce, en mesurant la taille moyenne des nanoparticules, du potentiel zêta et de la polydispersité. L’émulsion en question qui a été séchée par atomisation, a permis d’avoir un bio-fongicide sous forme de nano-capsules. L’essai de lutte contre l’alternariose par le bio-fongicide développé a montré que la nano émulsion à base d’huiles essentielles de menthe poivrée et de laurier a inhibé la croissance mycélienne d’A. alternata et ce, pour une dose de 1500 µg/mL sur des feuilles détachées de clémentinier var. MA3. De plus l’application de la nano-capsule à base des huiles essentielles de menthe poivrée et de laurier a montré un effet éliciteur sur le développement végétatif et a permis d’activer le système de défense chimique de la plante contrairement au fongicide de référence. L’étude in silico a permis d’identifier 10 gènes de type PR1 putativement impliqués dans la réponse au stress biotique. La phylogénie a montré des paires de gènes orthologues entre les gènes de clé mentiniers et d’Arabidopsis ou entre les gènes de clémentiniers et de C. sinensis. L’alignement mul tiple des séquences de toutes les protéines PR-1 de clémentiniers a confirmé l’omniprésence du do maine CAP conservé (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathogenesis-related 1 prote

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