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Université de Nîmes (2005)

Evolution de la diversité génétique des variétés locales de Sorgho au Niger entre 1976 et 2003 ; structuration génétique des sorghos en 2003

Herault, Damien

Titre : Evolution de la diversité génétique des variétés locales de Sorgho au Niger entre 1976 et 2003 ; structuration génétique des sorghos en 2003

Auteur : Herault, Damien

Université de soutenance : Université de Nîmes

Grade : Mémoire 2005

Résumé
Le sorgho (Sorghum bicolor), 5ème plante cultivée dans le monde, est essentiel pour l’alimentation humaine en Afrique et en Asie. Cette plante peut être cultivée dans des zones à faible pluviométrie, par exemple au Niger. Au cours de ces trente dernières années, le Niger a vu sa population doubler, connu plusieurs sécheresses et invasions acridiennes, et également une intensification de la culture dans certaines régions. Se pose alors la question de l’impact de ces différents facteurs sur l’évolution de la diversité génétique du sorgho dans ce pays. Afin d’étudier cet impact, une étude comparative de la diversité génétique du sorgho au Niger a été réalisée entre deux prospections de variétés de sorghos effectuées en 1976 et 2003. Mon stage a consisté à génotyper les 486 variétés récoltées en 2003 avec 32 marqueurs microsatellites. Les ADN extraits ont été amplifiés par PCR, réalisée en présence de fluorochromes et analysés sur séquenceur. La lecture du polymorphisme et les analyses de données réalisées à l’aide de différents logiciels ont permis de comparer les diversités génétiques globales des deux prospections et d’étudier la structuration de la diversité génétique des sorghos issus de la prospection 2003. Malgré les changements climatiques et socio-économiques observés au Niger, la diversité génétique globale du sorgho a peu évolué entre 1976 et 2003. La structuration spatiale de la diversité génétique des variétés prospectées en 2003 au Niger semble correspondre à une distribution raciale et variétale du Sorgho

Mots clés : SORGHUM BICOLOR VARIETE VARIATION GENETIQUE POLYMORPHISME GENETIQUE GENOTYPE MARQUEUR GENETIQUE MICROSATELLITE PCR PROVENANCE NIGER

Présentation : Agritrop

Page publiée le 23 juillet 2014, mise à jour le 22 décembre 2017