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Université des Frères Mentouri (Constantine 1) 2018

Biodiversité de la flore bactérienne du palmier dattier poussant au sud est Algérien. Effet du climat sur le comportement de cette flore

Aimene, Wissame

Titre : Biodiversité de la flore bactérienne du palmier dattier poussant au sud est Algérien. Effet du climat sur le comportement de cette flore

Auteur : Aimene, Wissame

Université de soutenance : Université des Frères Mentouri (Constantine 1)

Grade : Doctorat 3ème cycle En Biotechnologies microbiennes, Génomes et Environnement 2018

Résumé
La flore bactérienne des trois parties du palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) (Feuilles, fruits et tronc) a fait l′objet d′un isolement, puis identification suite aux tests phénotypiques et moléculaire (par le biais de l′ADNr 16S). L’évaluation de la population bactérienne à travers les différentes saisons (en 2012) a été effectuée pour démontrer la dynamique temporelle de la population cultivable. L′analyse statistique a révélé des différences significatives dans la distribution des souches bactériennes qui se traduit par une baisse ou une augmentation des niveaux de population pendant les différentes saisons. Les caractères morphologiques et les tests d’orientations simples ont permis de sélectionner 78 isolats représentatifs parmi plus de 200. Les résultats de l’identification phénotypique ont permis de classer la majorité des isolats au niveau de genre. Ainsi que, l’étude de l’effet des facteurs abiotiques sur la croissance des isolats a révélé que les isolats testés tolèrent et survivent dans des conditions abiotiques sévères. D′après l′analyse partielle du gène codant pour l‘ARNr 16S, 2 isolats ont été identifiés parfaitement avec 100% de similarité, des isolats ont été identifiés entre 97% à 99% de similarité avec celle des souches conservée dans Genbank, alors que d’autres souches ont été identifiées entre 78% à 96%. Globalement, on a recensé 33 espèces bactériennes appartenant à 16 genres. Les genres les plus présentés dans toutes les parties de l’arbre sont Bacillus (36,84 %), Pseudemonas et Enterobacter représentant 17,1 % pour chaqu’un, mais toutefois ces distributions sont hétérogènes. Lysinibacillus est le troisième genre le plus isolé avec 10,52%. Contrairement aux autres genres qui restent minoritaires telque Staphylococcus, Serratia, Microbacterium, Kluyvera, Arthrobacter, Stenotrophomonas, Exiguobacterium, Micrococcus, Klebsiella, Massilia, Erwinia, et Brevibacterium. Ce travail de recherche a donné et pour la première fois en Algérie une idée globale sur la diversité de la flore bactérienne du palmier dattier et mise en évidence de l’impact du climat sur la dynamique de cette flore

Mots clés : Phoenix dactylifera, Phyllosphère, ADNr 16S, diversité bactérienne

Présentation

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Page publiée le 20 novembre 2019